MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB04

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017184	TAC	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017184	TGA	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017184	GTAT	2	8	717	724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017184	GTG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017184	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017184	CTCAT	2	10	1047	1056	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017184	CT	3	6	1162	1167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017184	GAT	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017184	A	6	6	1261	1266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017184	AAG	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017184	AAT	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017184	CTCAA	2	10	2538	2547	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017184	GGT	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017184	CTT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017184	A	6	6	2865	2870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017184	TAGAA	2	10	2917	2926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017184	AGC	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017184	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017184	CAT	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017184	ATA	2	6	4031	4036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017184	A	6	6	4061	4066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017184	TGACAT	2	12	4072	4083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017184	TTGAG	2	10	4932	4941	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017184	CCT	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017184	AGG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017184	AAT	2	6	6100	6105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017184	TGC	2	6	6115	6120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017184	TGT	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017184	TTAA	2	8	6172	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017184	TTAA	2	8	6225	6232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017184	T	6	6	6820	6825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017184	TAAA	2	8	6849	6856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017184	ATT	2	6	6857	6862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017184	T	6	6	6871	6876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017184	T	7	7	6892	6898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017184	T	6	6	6906	6911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017184	TAAAT	2	10	6913	6922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017184	CAATA	2	10	6961	6970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017184	A	6	6	6982	6987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017184	AG	3	6	7010	7015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017184	GAC	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017184	A	6	6	7069	7074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017184	AAT	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017184	AT	3	6	7122	7127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017184	TAC	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017184	TTA	2	6	7835	7840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017184	AGCGA	2	10	7916	7925	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017184	A	6	6	9509	9514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017184	GATA	2	8	9556	9563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017184	TC	3	6	9850	9855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017184	AACAG	2	10	9920	9929	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017184	A	6	6	9954	9959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017184	GCT	2	6	10268	10273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017184	GAT	2	6	10305	10310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017184	ATC	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017184	CCT	2	6	10400	10405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017184	AGAAA	2	10	10462	10471	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017184	ATC	2	6	10512	10517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017184	TAA	2	6	10539	10544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017184	T	6	6	10560	10565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017184	ACC	2	6	10593	10598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017184	TTA	2	6	10642	10647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017184	ATA	2	6	10651	10656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017184	CAA	2	6	10664	10669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017184	TA	3	6	10678	10683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017184	A	7	7	10710	10716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017184	ATT	2	6	10719	10724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017184	TGC	2	6	10739	10744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017184	ATC	2	6	11243	11248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017184	AG	3	6	11324	11329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017184	TTC	2	6	11386	11391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017184	ATG	2	6	11428	11433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017184	CAAA	2	8	11483	11490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017184	ATTG	2	8	11496	11503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017184	ACGC	2	8	11513	11520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017184	A	7	7	11532	11538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017184	GATG	2	8	11559	11566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017184	GGA	2	6	11577	11582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017184	AACA	2	8	11586	11593	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017184	TA	3	6	11612	11617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017184	AAT	2	6	11666	11671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017184	T	6	6	11709	11714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017184	GCCA	2	8	11734	11741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017184	T	6	6	11767	11772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017184	TC	3	6	11805	11810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017184	AGC	2	6	11827	11832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017184	CTCAT	2	10	11858	11867	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017184	GCT	2	6	11924	11929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017184	TCAA	2	8	11930	11937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017184	TTC	2	6	11958	11963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017184	TA	4	8	12005	12012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017184	GTCA	2	8	12015	12022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017184	A	6	6	12053	12058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017184	A	6	6	12235	12240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017184	TCG	2	6	12261	12266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017184	T	6	6	12338	12343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017184	AAT	2	6	12359	12364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017184	TGGA	2	8	12379	12386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017184	TAC	2	6	12403	12408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017184	TAT	2	6	12414	12419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017184	TAAT	2	8	12429	12436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017184	TA	3	6	12440	12445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017184	AT	3	6	12449	12454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017184	TAT	3	9	12452	12460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017184	AATA	2	8	12461	12468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017184	AT	3	6	12494	12499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017184	TA	3	6	12503	12508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017184	TAT	2	6	12515	12520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017184	ATTT	2	8	12533	12540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017184	TAT	2	6	12546	12551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017184	TAT	2	6	13433	13438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017184	AT	3	6	13448	13453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017184	CTTG	2	8	13766	13773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017184	A	6	6	13785	13790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017184	AAGG	2	8	13825	13832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017184	GCT	2	6	13881	13886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017184	TTA	2	6	13892	13897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017184	GTA	2	6	13927	13932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017184	T	6	6	13955	13960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017184	AGGA	2	8	13984	13991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017184	TA	3	6	14597	14602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017184	AAG	2	6	14617	14622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017184	GCT	3	9	14740	14748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017184	A	6	6	14749	14754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017184	ATA	2	6	14761	14766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017184	TATAAG	2	12	14775	14786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017184	T	7	7	14834	14840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017184	T	7	7	14867	14873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017184	T	6	6	14892	14897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017184	TTCT	2	8	14927	14934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017184	TAT	2	6	14975	14980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017184	CCA	2	6	14999	15004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017184	TTG	2	6	15052	15057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017184	CAA	2	6	15088	15093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017184	C	6	6	15104	15109	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_017184	TAA	2	6	15115	15120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017184	TCTA	2	8	15153	15160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017184	TTAA	2	8	15713	15720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017184	ATAGG	2	10	15752	15761	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017184	A	6	6	15960	15965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017184	TTC	2	6	16039	16044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017184	AGCGA	2	10	16057	16066	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017184	TCT	2	6	16078	16083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017184	CT	3	6	17246	17251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017184	T	6	6	17280	17285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017184	CAA	2	6	17313	17318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017184	TGT	2	6	17342	17347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017184	GTT	2	6	17393	17398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017184	T	8	8	17413	17420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017184	AGA	2	6	17497	17502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017184	AAT	2	6	17521	17526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017184	TCA	2	6	17566	17571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017184	TAA	2	6	17617	17622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017184	ATTC	2	8	17672	17679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_017184	ATTA	2	8	17688	17695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017184	GA	3	6	17718	17723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017184	T	6	6	18105	18110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017184	CG	3	6	18170	18175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_017184	GCA	2	6	18272	18277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017184	TTA	2	6	18335	18340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017184	AG	3	6	18411	18416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017184	ATT	2	6	18441	18446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017184	ATAA	2	8	18454	18461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.